Rapporten redegør for erfaringerne med ordningen med krydsoverensstemmelse, som betinger udbetalingen af EU’s landbrugsstøtte af overholdelsen af en række krav om miljø, fødevaresundhed, dyrevelfærd og dyresundhed. Det anerkendes, at der er behov for, at systemet er så ensartet som muligt i alle medlemslande, så de kan tilpasse systemet til deres specifikke behov. Krydsoverensstemmelse forventes også at indgå i sundhedschecket i 2008.

På baggrund af de indhentede erfaringer foreslår Kommissionen i sin rapport blandt andet: 

• indførelse af bagatelgrænser, hvor mindre førstegangs overtrædelser ikke fører til en sanktion, men en advarsel, samt en bagatelgrænse, så sanktioner op til 50 EUR ikke effektueres,
• en regulering af kontrolfrekvensen, så denne i praksis kan fastholdes på 1 % som forudsat for krydsoverensstemmelse (anden kontrol af regler, som indgår i krydsoverensstemmelse vil fortsat blive indberettet og kan resultere i sanktioner i fbm. krydsoverensstemmelse), 
• mulighed for varsling af landbrugeren forud for kontrol af arealrelaterede regler og støttebetingelser, 
• tilrettelæggelse af kontrollen på det mest relevante tidspunkt i forhold til de specifikke krav, 
• sikring af information af landbrugerne om krydsoverensstemmelse, og 
• forenkling af 10-måneders rådighedsperioden.

Kommissionen lægger op til yderligere drøftelser og udvikling af ideer til "best practice" og øget mulighed for anvendelse af flaskehalskontrol fx på mejerier og slagterier som en slags indikatorkontrol.

Endvidere foreslår Kommissionen, at reglerne om krydsoverensstemmelse inden for miljø, dyre-, plante-, og folkesundhed samt dyrevelfærd bliver indfaset over en treårig periode i de nye medlemslande, ligesom det er sket i EU-15.